Az ELIXIR elfogadta az Integration and standardization of intrinsically disordered protein data Implementation Study indítványt magyar részről Dosztányi Zsuzsanna vezetésével. Ez tagja annak a 6 indítványnak, amely a 2018-as évre a Data Platform keretében elfogadásra került a benyújtott 17-ből. A projekt futamideje: 2018.06.01-2019.05.31.
Az Implementation Study-k olyan rövidtávú (1-2 éves), a Hub által a Node-okhoz kihelyezett szolgáltatások, melyekhez a Node-ok támogatásban részesülnek a Hub felől. A nyertes indítványok független szakértői felülvizsgálat után lettek kiválasztva a bioinformatikában és kapcsolódó szolgáltatások nyújtásában jártas szakemberek által. A kiválasztás a Core Data Resource-ok kritériumaira támaszkodott.
Az Integration and standardization of intrinsically disordered protein (IDP) data beadvány partnerei:
Node | Vezető kutató (PI) | Szerep | |
IT | Silvio Tosatto | vezető | ![]() |
EBI | Rob Finn (InterPro) | tag | ![]() |
EBI | Maria Martin (UniProt) | tag | ![]() |
EBI | Sandra Orchard (UniProt, IntAct) | tag | ![]() |
EBI | Sameer Velankar (PDBe) | tag | ![]() |
CH | Alan Bridge (UniProt) | tag | ![]() |
HU | Zsuzsanna Dosztányi | tag | ![]() |
IR | Norman Davey | társ vezető | ![]() |
Célja az IDP-hez kapcsolódó annotáció bevezetése az UniProt és PDBe Core Data Resource-okba, ezáltal garantálva az IDP kutatói közösségének hosszútávú elérhetőséget. A projekt első része az annotáció bevezetése az említett adatbázisokba az InterPro és a MobiDB-lite szoftvercsomaggal. Másodjára, létre kívánnak hozni egy Minimal Information About Disorder Experiments (MIADE) formátumot a rendezetlenségi adatok egyértelmű közlésére és aPI-t az adatázisok közötti mozgatáshoz. Végül egy új adatbázist állítanak össze (PubDisProt) PubMed ID-k és IDP-k azonosítóinak összekapcsolásával a meglévő adatbázisok közötti annotáció csere és az karbantartásuk megkönnyítésére. Dosztányi Zsuzsanna vezetésével a magyar Node mindhárom részfolyamatban részt vállal.
Silvio Tosatto (b) és Dosztányi Zsuzsanna